Ketegangan memuncak di jam kelima ketika Jack Miller dari Yamaha sempat memangkas jarak menjadi 21 detik. Namun, Zarco berhasil meningkatkan kecepatannya dan mencatat lap tercepat, membuat jarak kembali melebar.
Drama kembali terjadi menjelang akhir balapan ketika dua kali safety car masuk ke lintasan dan menghapus keunggulan Honda. Safety car terakhir bahkan sempat membuat Yamaha No. 21 unggul setelah Zarco tertahan di pintu keluar pit karena lampu merah. Namun, pit stop terakhir Yamaha membuat Zarco kembali memimpin hingga finis di bawah lampu sorot Suzuka.
Kemenangan ini diikuti Yamaha No. 21 yang dikendarai Jack Miller, Andrea Locatelli, dan Katsuyuki Nakayama di posisi kedua.
Suzuki Yoshimura No. 1 yang ditunggangi Gregg Black, Dan Linfoot, dan Cocoro Atsumi melengkapi podium di posisi ketiga, meski sempat mengalami insiden di jam kedua dan tertinggal dua putaran dari Honda.
Di belakang mereka, Harc-Pro Honda No. 37 yang diperkuat Kunii, Keito Abe, dan Teppei Nagoe menyelesaikan balapan di posisi keempat. BMW pabrikan No. 37 yang dikendarai Michael van der Mark, Markus Reiterberger, dan Steven Odendaal menutup lima besar setelah sempat terjatuh akibat footpeg patah di jam ketiga.